在穆勒的自由主义哲学代表作《论自由》中，他先是界定了自己所称的“自由”与当时风靡一时的所谓“意志自由”之间的不同，提出了“多数人的暴政”这样一种激进、深刻而一针见血的观点，然后探讨了个人的“思想与讨论之自由”“个性自由”“自由原则之应用”等几个方面，并且各自成章，旁征博引而又条理分明，向读者呈现了他对“自由”的整体思考。